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sw转cad映射文件是为SolidWorks用户打造的一款辅助工具，我们知道使用SolidWorks输出的图纸会出现无法使用cad编辑的问题，使用这款工具就可以将SW图纸的图层映射到DWG 或DXF格式的CAD图纸中了，然后就可以编辑或者打印了，欢迎下载。

生信分析：常用文件数据库地址（GO,uniref） - 简书

-A United States prepared by Dr. meshing process. Very practical, specific ways we can use the online search to see, this is a MATLAB and C mixed. (系统自动生成,下载前可以参看下载内容) 3.4 数据下载. UniProt所有数据均可免费下载，其数据发布基于国际知识共享(Creative Commons Attribution CCBY 4.0)许可(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。该网站数据下载页面详细列出UniProtKB、UniRef和UniParc等不同数据集专用文件下载服务器(FTP)的链接，同时包括常见问题回答(FAQ)和必读文档(README)等，为用户特别是初学者提供了有用的信息。 UniProt NREF(UniRef)数据库为高效率的搜寻提供适当的蛋白质的全信息数据库的代表性的子集。全面的UniProt 档案(UniParc)每天从很多公共来源数据库更新。数据库那些UniProt接口可在线访问(http://www.uniprot.org)或者以几个形式下载(ftp：//ftp.uniprot.org/pub)。进化方法的Unifrac分析需要进化树文件，可提供更生物学的解析，但缺少树文件时无法使用。可提供alpha， beta多样性分析的软件有QIIME、Mothur和R语言vegan包(usearch也可以)。安装没什么可讲的，下载安装包（源码），解压，设置环境变量就可以了。要注意的是 HUMAnN2 依赖于两个数据库（ ChocoPhlAn 和 UniRef ），他的安装包里面只有这两个数据库的 DEMO 版本。所以我们首先要下载完整的版本。使用迅雷，简单粗暴（微笑脸）在安装完依赖软件，下载好数据库后就可以进行实战分析了，仅需一行命令即可进行宏基因组数据上游处理，包括质量控制，菌群分类分析，功能分析，菌株分析等等。首先需要创建容器，这里我用-v参数进行目录映射，--rm参数，退出容器后删除该容器。上述常用的蛋白质．小分子对接算法和软件中，在准确率上，没有哪个算法占有绝对的优势。.

05.06.2021 下载uniref映射文件

批量下载蛋白fasta文件目的：计算蛋白特征1、最初尝试：利用R getFASTAFromUniProt函数library(Rcpi)# 处理fasta文件rm(list Ubuntu18.04+BLAST环境下安装Swiss-Prot和UniRef（二）【注：可以通过wget直接下载在服务器指定的文件夹下】 2. 目录关系数据库注释管理系统论文背景关键词简介结果总结相关工作三个蛋白质数据库，一个映射表和三个pSQL查询的结果 HUMAnN 3 使用来自ChocoPhlAn 泛基因组的UniRef90 功能注释数据以进行记录的信息包括流程的各项命令和参数，可执行文件的版本以及每个任务的输出文件。 ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/all/GCA 下载每个蛋白质组的参考基因组（ fasta 首先需要创建容器，这里我用 -v 参数进行目录映射， --rm 参数，退出容器后数据库(UniRef)和UniProt存档(UniPArc), 一组蛋白质序列及其历史. 蛋白质序列及 (下载对齐文件)和系统发生树(下载系统发生树数据). 使用可视化许多映射程序. 配置文件，原始数据和程序集可在//hmpdacc.org（扩展数据表1b）和//aws.amazon.com/datasets/human-microbiome-project/上下载PowerPoint幻灯片通过针对基于UniRef的蛋白质序列目录43的翻译搜索进一步映射剩余的未映射的读数。例如，包含多个测序读取的测序文件可被分解成较小的组件(例如一个或多个测序读 C.H.UniRef: comprehensive and non — redundant UniProt reference clusters.

如何对基因组序列进行注释-二级连动菜单-WinFrom控件库 .net开源

通过对于每个样品将所有读取映射到手动构建的病毒共有基因组序列来确定编号主题简介11Linux基础简介、远程登陆、文件传输、常用命令12Linux软件与配置，宏基因组相关软件安装和数据库下载13Win软件安装git、R、Rstudio、R /EggNOG、CAZy/dbcan2、ARDB/Resfams/CARD、Uniref、VFDB、TCDB34 doc es 中type_Elasticsearch(024)：es常见的字段映射类型之连接类型(join type). 同源注释：从Phytozome上下载了7个植物的基因组蛋白序列(Arabidopsis 不同从头预测软件的实际效果可以通过在IGV中加载文章提供的gff文件和预测后 PASA流程提到的UniRef90作为同源注释的搜索数据库可能是更好的选择，由于UniRef优先阿里JAVA手册之MySQL数据库（建表规约、索引规约、SQL语句、ORM映射 by 张蕾 · 2017 — Q、R、S、T、V、W 和Y 组成的氨基酸序列映射为对应的. 二级结构序列。 nr(ftp://ftp.uniprot.org/pub/databases/uniprot/uniref/) 数据库下.

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2.去官网下载Python解释器（3.6版本以上）或者Anaconda，安装在本地. 注：分享一个获取pycharm破解版的网址：https://www.cnblogs.com/xuexianqi/p/12767075.html 2.3 蛋白质序列参考集UniRef.

humman3下载数据库中断的解决策略. 12——墨涩网RaiDrive 是一款能够将一些网盘映射为本地网络磁盘的工具，让你可以 0； 2）蛋白注释使用UniProt/UniRef 2019_01序列和注释信息； 3）物种数量是HUMAnN2的2倍多， 04 Dropbox 授权以及文件下载操作Github上Faster-RCNN_TF代码填坑这是 PROT 的条目用外在的 ASCII 文件表示,两者的主要差别在于特征表的不同。 4.3.3 TrEMBL 141 大多数蛋白质序列不是直接由实验得到,而是通过 DNA 序列映射而得到的。 ( 2 ) UniProt Non - redundant Reference ( UniRef )数据库,该数据库将查询数据库,可以利用 BLAST 程序搜索数据库,也可以直接通过 FTP 下载数据。 UniProt Reference Clusters（UniRef）：聚类序列可显著减小数据库大小，从而加快序列搜索的速度。用于计算的蛋白质序列来自UniProtKB和部分UniParc记录的序列。UniRef100序列将相同的序列和序列片段（来自任何生物）合并到一个UniRef条目中，用于显示代表性蛋白质的序列。 UniProt NREF(UniRef)数据库为高效率的搜寻提供适当的蛋白质的全信息数据库的代表性的子集。全面的UniProt 档案(UniParc)每天从很多公共来源数据库更新。数据库那些UniProt接口可在线访问(http://www.uniprot.org)或者以几个形式下载(ftp：//ftp.uniprot.org/pub)。文章目录简介安装数据库下载运行参考简介安装 conda install humann humann_test (~1 minute) 数据库下载 humann_databases --download chocophlan full /path/to/databases --update-config yes humann_databases --download uniref uniref90_diamond /path/to/databases --update-config yes humann_ 进化方法的Unifrac分析需要进化树文件，可提供更生物学的解析，但缺少树文件时无法使用。可提供alpha， beta多样性分析的软件有QIIME、Mothur和R语言vegan包(usearch也可以)。 Step3:a.建立新的文件存储临时文件. mkdir split_files #存储临时文件 mkdir humann2_out # 存储由HuMAnN2产生的文件 mkdir humann2_tables # 存储最终的表格 Step3:b.将PICRUSt的宏基因组预测表格（.biom）拆分成单个的biom文件. humann2_split_table \ -i metagenomic_predictions.biom \ -o split_files 1.去官网下载Pycharm专业版，社区版没有远程调试功能，要序列号，用学校邮箱注册一个，安装在本地.

而单细胞免疫组库目前还缺乏成熟的数据分析软件。. 通过构建screpertoire，用户可以很容易地结合mrna和免疫组分析，从而处理来自10xgenomics的t细胞受体库 (tcr)和免疫球蛋白 (ig)工作流程的免疫分析数据，并与流行的seurat r包兼容。. 如图6-7所示图6-7 UniProt网站主页 ?UniProt包含UniProtKB、UniRef 和UniParc 3个部分：（1）UniProtKB数据库（UniProt Knowledgebase）：蛋白质序列、功能、分类、交叉引用等信息存取中心；（2）UniRef数据库（UniProt Reference Clusters）：为提高检索的速度，将紧密相关的蛋白质序列合并到同一条记录中。 1.去官网下载Pycharm专业版，社区版没有远程调试功能，要序列号，用学校邮箱注册一个，安装在本地. 2.去官网下载Python解释器（3.6版本以上）或者Anaconda，安装在本地.

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人类核糖核苷酸还原酶的模拟分子对接——所有资料文档均为本人悉心收集，全部是文档中的精品，绝对值得下载收藏！ UniRef：Sequence clusters, used to speed up similarity searches.（为提高检索速度，将紧密相关的蛋白质序列合并到同一条记录中） 1 PDB1.1970年代建立，美国Brookhaven国家实验室维护管理;2. 988年，由美国RCSB(research collaboratory for structural biology)管理；3. 蛋白质序列数据库我们可以根据基因组序列预测新基因，预测编码区域，并推测其产物（即蛋白质）的序列。因此，随着基因组序列的不断增长，蛋白质序列也在不断增加。PIR历史上，蛋白质数据库的出现先于核酸数据库。在1960年左右，Dayhoff和其同事们搜集了当时所有已知的氨基酸序列，编著了简介、远程登陆、文件传输、常用命令: 12: Linux软件安装: Conda安装与配置，宏基因组相关软件安装和数据库下载: 13: Win软件安装: git、R、Rstudio、R包、STAMP、AI等: 14: 图表解读: 常用分析图表在文章中意义和使用场景: 15: R基础: 发展史、生物学中应用、ggplot2绘图: 16: 可视化识别配体-蛋白质结合位点的方法和系统技术领域本发明提供一种基于集成结构和系统的配体(例如药物)靶点预测新方法，所述方法可以大规模发现现有药物的新靶点。本发明还提供新型计算机可读存储介质和计算机系统。本发明的方法和系统采用新型序列次序-无关结构比对法、分裂层次聚类法及用于多重分类学分类的方法和系统与流程分类号学号 M201371570 码学校代码 1 0 4 8 7 密级硕士学位论文综合神经肽信息数据库构建学位申请人：王明霞学科专业：生物物理学指导教师：王燕副教授答辩日期： 2016 年年 5 月月 17 日万方数据 A Thesis Submitted in Partial Fulfillment of the Requirements for the Degree of Master of Science A JournalofCompu~rApplications计算机应用，017，375：151—1515ISSN10019081CODENJYIIDU017．05．10http：／／www．joca．ca文章编号：1001-908101705．151-04DOI：10．1177／j．issn．1001-9081．017．05．151基于深度学习的八类蛋白质二级结构预测算法张蕾，李征，郑逢斌，杨伟’河南大学计算机与信息工程学院，河南开封475004通信微信扫下方二维码即可打包下载完整版《★生物学》题库题库试看结束后微信扫下方二维码即可打包下载完整版《生物学：生物信息学》考试资料下载，在线测试 1、单项选择题没有直接参与完成人类基因组计划的国家《生物信息学》讲义.doc,《生物信息学》讲义 Bioinformatics （08～09学年春季学期 2006级生物技术专业用）任课教师：王传铭红河学院生物系 2009年2月～7月第一章绪论一引言传统的生物学是一门实验科学，生物学研究依赖于对实验数据的处理和分析。分类号：b三!墨udc：重庆医科大学密级：硕士学位论文论文题目利用svm挖掘gpcr中潜在的药物靶点作者姓名王春丽指导教师姓名职称、单位名称张世强教授重庆医科大学数学教研室申请学位级别硕士学科、专业名称生物医学工程论文答辩年月013年5月013年5月f辫嬲重庆医科大学．研究生学位论文独创性蛋白质功能预测的非同源性计算方法研究作者姓名：马志强吉林大学分类号：单位代码： 10183 研究生学号： 200XX XX XX X 密级：吉林大学博士学位论文马志强 2009 年 3 月 2 ———————————————————————— 蛋白质功能预测的非同源性计算方法研究下载百度网盘里面的文件先打开谷歌浏览器，先使用Google文件下载插件下载点击下载项，弹出如图所示界面按住鼠标直接拖拽如图鼠标所指位置，进行复制，拖一下就好结果如图于是变得到该下载项的直链链接，将该链接复制到其他下载工具即可其实也可以神经网络学习到的特征对网络来说是等价的无差异的，通过注意力机制能够忽略图像中的无关信息而关注重点信息。近年来通过集中于使用掩码（mask）来形成注意力机制，掩码原理是通过一层新的权重，将图片中关键的特征每个二级结构类型都是由其所在蛋白质链中氨基酸残基间的局部和长程相互作用共同决定的。蛋白质二级结构预测任务就是把一个由20种氨基酸a、c、d、e、f、g、h、i、k、l、m、n、p、q、r、s、t、v、w和y组成的氨基酸序列映射为对应的二级结构序列。 8.2.9 名字空间和老代码 163 8.3 异常 166 8.3.1 抛出和捕捉 167 8.3.2 异常的辨识 168 8.3.3 在计算器中的异常 169 8.4 忠告 173 8.5 练习 173 第9章源文件和程序 175 9.1 分别编译 175 9.2 连接 176 写写帮文库为你整理了多篇VC++6.0 中用 ADO 存取 Access 数据库的一点总结，但愿对你工作学习有帮助，当然你还可以在写写帮文库找到更多VC++6.0 中用 ADO 存取 Access 数据库的一点总结。软件系|宏基因组分析-- humann 3.0. 发布于 2021-04-08 16:27 UniRef参考序列集按相似性程度将UniProtKB和UniParc中的序列分为UniRef100、UniRef90和UniRef50三个数据集。批量提取和登录号映射(Retrieve/ID Mapping)工具和多肽搜索工具(Peptide Search)。该网站数据下载页面详细列出UniProtKB、UniRef和UniParc等不同数据集专用文件下载服务器(FTP)的 GO注释下载数据库来源： GO官网[http://current.geneontology.org/products/pages/downloads.html] 格式是GA The UniProt Reference Clusters (UniRef) provide clustered sets of UniRef90 is built by clustering UniRef100 sequences with 11 or more UniProtKB (0); UniRef (0); UniParc (0). Align BLAST Map Ids Download Full View Remove Clear. 2020-10-072021_01UniProt Knowledgebase and related 后来用户可以通过ftp服务器访问EMBL，下载相关的数据及各种程序。列数据，同时还有一些辅助文件，存放于序列相关的辅助信息，如作者名、基因名、大多数蛋白质序列不是直接由实验得到，而是通过DNA 序列映射而得到的。 Non－redundant Reference（UniRef）数据库，该类似，每一个SWISS-PROT的条目用外在的ASCII文件表示，两者主要差别在于特征表大多数蛋白质序列不是直接由实验得到，而是通过DNA序列映射而得到的。等信息存取中心；（2）UniProt Non-redundant Reference（UniRef）数据库，该数据库，可以利用BLAST程序搜索数据库，也可以直接通过FTP 下载数据。 UniProt作为数据仓库，再分别给UniProtKB，Proteomes，UNIRef提供可靠的下面以 PO5F1_HUMAN 为例，下载对应的fasta序列来看看：. 批量下载蛋白fasta文件目的：计算蛋白特征1、最初尝试：利用R getFASTAFromUniProt函数library(Rcpi)# 处理fasta文件rm(list Ubuntu18.04+BLAST环境下安装Swiss-Prot和UniRef（二）【注：可以通过wget直接下载在服务器指定的文件夹下】 2.

humann2_split_table \ -i metagenomic_predictions.biom \ -o split_files 1.去官网下载Pycharm专业版，社区版没有远程调试功能，要序列号，用学校邮箱注册一个，安装在本地. 2.去官网下载Python解释器（3.6版本以上）或者Anaconda，安装在本地. 注：分享一个获取pycharm破解版的网址：https://www.cnblogs.com/xuexianqi/p/12767075.html 在安装完依赖软件，下载好数据库后就可以进行实战分析了，仅需一行命令即可进行宏基因组数据上游处理，包括质量控制，菌群分类分析，功能分析，菌株分析等等。首先需要创建容器，这里我用-v参数进行目录映射，--rm参数，退出容器后删除该容器。 SAM1.什么是SAM格式？SAM格式用于存储基于参考序列的比对序列，SAM(Sequence Alignment Map)是序列比对映射的首字母缩写。说明SAM是带有比对信息的序列文件（告诉你reads在染色体中的位置）。2.SAM包含什么内容？（1）标头注释部分（header section）header每一行以@开头。输入文件可以是以下几类文件; 1. 质量控制的霰弹枪宏基因组或metatranscriptomes（fastq，fastq.gz，fasta或fasta.gz） 2. 映射结果（sam，bam或blastm8） 3. 基因丰度表（tsv或biom）物种组成调用MetaPhlAn2, bowtie2比对至核酸序列；功能组成为humann2调用diamond比对至蛋白库11Gb 介绍说明.

（2）UniProt Non-redundant Reference（UniRef）数据库，该数据库将密切相关的蛋白质序列组合到一条记录中，以便提高搜索速度；目前，根据序列相似程度形成3个子库，即UniRef100、UniRef90和UniRef50；（3）UniProt Archive（UniParc），是一个资源库，记录所有蛋白质序列的历史。下载百度网盘里面的文件先打开谷歌浏览器，先使用Google文件下载插件下载点击下载项，弹出如图所示界面按住鼠标直接拖拽如图鼠标所指位置，进行复制，拖一下就好结果如图于是变得到该下载项的直链链接，将该链接复制到其他下载工具即可其实也可以简介、远程登陆、文件传输、常用命令: 12: Linux软件安装: Conda安装与配置，宏基因组相关软件安装和数据库下载: 13: Win软件安装: git、R、Rstudio、R包、STAMP、AI等: 14: 图表解读: 常用分析图表在文章中意义和使用场景: 15: R基础: 发展史、生物学中应用、ggplot2绘图: 16: 可视化蛋白质序列数据库我们可以根据基因组序列预测新基因，预测编码区域，并推测其产物（即蛋白质）的序列。因此，随着基因组序列的不断增长，蛋白质序列也在不断增加。PIR历史上，蛋白质数据库的出现先于核酸数据库。在1960年左右，Dayhoff和其同事们搜集了当时所有已知的氨基酸序列，编著了识别配体-蛋白质结合位点的方法和系统技术领域本发明提供一种基于集成结构和系统的配体(例如药物)靶点预测新方法，所述方法可以大规模发现现有药物的新靶点。本发明还提供新型计算机可读存储介质和计算机系统。本发明的方法和系统采用新型序列次序-无关结构比对法、分裂层次聚类法及用于多重分类学分类的方法和系统与流程摘要: 蛋白质二级结构预测是结构生物学中的一个重要问题。针对八类蛋白质二级结构预测，提出了一种基于递归神经网络和前馈神经网络的深度学习预测算法。该算法通过双向递归神经网络建模氨基酸间的局部和长程相互作用，递归神经网络的隐层输出进一步送入到三层的前馈神经网络以便进行八微信扫下方二维码即可打包下载完整版《★生物学》题库题库试看结束后微信扫下方二维码即可打包下载完整版《生物学：生物信息学》考试资料下载，在线测试 1、单项选择题没有直接参与完成人类基因组计划的国家是（）。蛋白质功能预测的非同源性计算方法研究作者姓名：马志强吉林大学分类号：单位代码： 10183 研究生学号： 200XX XX XX X 密级：吉林大学博士学位论文马志强 2009 年 3 月 2 ———————————————————————— 蛋白质功能预测的非同源性计算方法研究《生物信息学》讲义.doc,《生物信息学》讲义 Bioinformatics （08～09学年春季学期 2006级生物技术专业用）任课教师：王传铭红河学院生物系 2009年2月～7月第一章绪论一引言传统的生物学是一门实验科学，生物学研究依赖于对实验数据的处理和分析。随着生物科学和技术的迅速发展，生物数据积累分类号：b三!墨udc：重庆医科大学密级：硕士学位论文论文题目利用svm挖掘gpcr中潜在的药物靶点作者姓名王春丽指导教师姓名职称、单位名称张世强教授重庆医科大学数学教研室申请学位级别硕士学科、专业名称生物医学工程论文答辩年月013年5月013年5月f辫嬲重庆医科大学．研究生学位论文独创性 JournalofCompu~rApplications计算机应用，017，375：151—1515ISSN10019081CODENJYIIDU017．05．10http：／／www．joca．ca文章编号：1001-908101705．151-04DOI：10．1177／j．issn．1001-9081．017．05．151基于深度学习的八类蛋白质二级结构预测算法张蕾，李征，郑逢斌，杨伟’河南大学计算机与信息工程学院，河南开 … 分类号学号 M201371570 码学校代码 1 0 4 8 7 密级硕士学位论文综合神经肽信息数据库构建学位申请人：王明霞学科专业：生物物理学指导教师：王燕副教授答辩日期： 2016 年年 5 月月 17 日万方数据 A Thesis Submitted in Partial Fulfillment of the Requirements for … csdn已为您找到关于空间注意力机制相关内容，包含空间注意力机制相关文档代码介绍、相关教程视频课程，以及相关空间注意力机制问答内容。为您解决当下相关问题，如果想了解更详细空间注意力机制内容，请点击详情链接进行了解，或者注册账号与客服人员联系给您提供相关内容的帮助，以下 csdn已为您找到关于空间注意力机制代码相关内容，包含空间注意力机制代码相关文档代码介绍、相关教程视频课程，以及相关空间注意力机制代码问答内容。为您解决当下相关问题，如果想了解更详细空间注意力机制代码内容，请点击详情链接进行了解，或者注册账号与客服人员联系给您提供相关写写帮文库为你整理了多篇VC++6.0 中用 ADO 存取 Access 数据库的一点总结，但愿对你工作学习有帮助，当然你还可以在写写帮文库找到更多VC++6.0 中用 ADO 存取 Access 数据库的一点总结。前言. 继 MetaPhlAn 之后，今天整理分享的是 biobakery 另一个成员 HUMAnN 3.0（the HMP Unified Metabolic Analysis Network），也是 HMP项目的历史产物。. 本文使用说明有点长，建议先收藏，需要的时候再翻出来看看。 Vmware的下载与详细安装 VMware是全球虚拟化解决方案的领导厂商,在虚拟化和云计算基础架构领域处于全球领先地位。VMware Workstation是一款功能强大的虚拟化计算软件，你可以在其中虚拟化运行windows_xp_7_8_10_server、linux(centos、ubuntu)等几乎所有版本的操作系统。 UniProt Reference Clusters（UniRef）：聚类序列可显著减小数据库大小，从而加快序列搜索的速度。用于计算的蛋白质序列来自UniProtKB和部分UniParc记录的序列。UniRef100序列将相同的序列和序列片段（来自任何生物）合并到一个UniRef条目中，用于显示代表性蛋白质的序列。 sw转cad映射文件是为SolidWorks用户打造的一款辅助工具，我们知道使用SolidWorks输出的图纸会出现无法使用cad编辑的问题，使用这款工具就可以将SW图纸的图层映射到DWG 或DXF格式的CAD图纸中了，然后就可以编辑或者打印了，欢迎下载。 JAVA项目文件下载、浏览接口关于文件上传参照我以前写的这个java项目文件上传文章如果要接口的写法的话，可以下载这个文件上传下载例子下载地址本篇文章只说文件下载部分 /** * 文件下载接口 * @param filePath 文件上传时，返回的相对路径 * @param response * @param UniProt NREF(UniRef)数据库为高效率的搜寻提供适当的蛋白质的全信息数据库的代表性的子集。全面的UniProt 档案(UniParc)每天从很多公共来源数据库更新。数据库那些UniProt接口可在线访问(http://www.uniprot.org)或者以几个形式下载(ftp：//ftp.uniprot.org/pub)。文章目录简介安装数据库下载运行参考简介安装 conda install humann humann_test (~1 minute) 数据库下载 humann_databases --download chocophlan full /path/to/databases --update-config yes humann_databases --download uniref uniref90_diamond /path/to/databases --update-config yes humann_ 进化方法的Unifrac分析需要进化树文件，可提供更生物学的解析，但缺少树文件时无法使用。可提供alpha， beta多样性分析的软件有QIIME、Mothur和R语言vegan包(usearch也可以)。 Step3:a.建立新的文件存储临时文件. mkdir split_files #存储临时文件 mkdir humann2_out # 存储由HuMAnN2产生的文件 mkdir humann2_tables # 存储最终的表格 Step3:b.将PICRUSt的宏基因组预测表格（.biom）拆分成单个的biom文件. humann2_split_table \ -i metagenomic_predictions.biom \ -o split_files SAM1.什么是SAM格式？SAM格式用于存储基于参考序列的比对序列，SAM(Sequence Alignment Map)是序列比对映射的首字母缩写。说明SAM是带有比对信息的序列文件（告诉你reads在染色体中的位置）。2.SAM包含什么内容？（1）标头注释部分（header section）header每一行以@开头。输入文件可以是以下几类文件; 1. 质量控制的霰弹枪宏基因组或metatranscriptomes（fastq，fastq.gz，fasta或fasta.gz） 2. 映射结果（sam，bam或blastm8） 3.